Patiño disfrutaba de un baño en El Ahorcado, del sitio Ayampe, parroquia Salango, del cantón Puerto López, en compañía de una chica de 20 años y cuando eran las 14h00 el mar los arrastró a ambos. La chica, de nombre María Fernanda, se salvó, mas no Emilio, quien fue arrastrado por la corriente. Estas playas son lugares favoritos para practicar deportes extremos y el surf por lo fuerte del oleaje. Inmediatamente, los comuneros y personas que estaban en la playa comunicaron del hecho a la Policía de Puerto López y a los pocos minutos buzos de Salango y de la cabecera cantonal llegaron hasta El Ahorcado e iniciaron la búsqueda del cuerpo. Siendo las 15h45, el cadáver de Emilio Patiño fue encontrado en una zona pedregosa, a 200 metros del sitio donde se ahogó. Tenía golpes en la cabeza y cuerpo Hasta las playas del sur manabita llegó, en helicóptero, el ministro Ricardo Patiño para indagar lo sucedido. No dio declaraciones a la prensa. Con él se movilizaron los hijos de Emilio, Diana y Daniel, y personal militar y del Gobierno. El cuerpo de Patiño permaneció en la playa El Ahorcado, debajo de una ramada, durante más de cuatro horas a la espera de que llegara el fiscal de Jipijapa para realizar el levantamiento del cadáver. Después de cumplir con los procedimientos legales, el cuerpo de Emilio Patiño fue trasladado a Guayaquil.